La gran fortuna con la que se ha hecho Wario en sus diversas aventuras de Game Boy y Game Boy Advance ha dejado al descubierto una nueva faceta suya: ¡Wario sabe sonreír y está muy feliz! Entre las riquezas que posee en Wario World, hay un objeto muy especial: la Gema Negra, una piedra con la extraña capacidad de transformar los tesoros en terroríficos y fieros monstruos. La misión de Wario en esta aventura será derrotar a los monstruos, en los que se han transformado sus riquezas, para recuperar todo aquello que con "tanto esfuerzo" ha logrado reunir.