Nuevamente el mundo está al borde del desastre nuclear cuando el prototipo más nuevo y avanzado de Metal Gear cae en manos de un grupo de terroristas. Asume otra vez el papel de Solid Snake y lleva a cabo varias misiones muy peligrosas sin que nadie te detecte ni te detenga mientras te infiltras en el corazón del territorio enemigo. Avanzarás por sorprendentes escenarios en 3D muy reales e interactivos mientras utilizas una mezcla de cámaras con vista en primera y tercera persona para alcanzar tu objetivo.